Isolation of Myxobacteria from Soil and RFLP Analysis of 16S rDNA Fragments.

토양으로부터 Myxobacteria의 분리 및 165 rDNA RFLP분석

  • 김수광 (유한양행 중앙연구소 바이오텍 연구실) ;
  • 최병현 (유한양행 중앙연구소 바이오텍 연구실) ;
  • 김종균 (유한양행 중앙연구소 바이오텍 연구실) ;
  • 이병규 (유한양행 중앙연구소 바이오텍 연구실) ;
  • 강희일 (유한양행 중앙연구소 바이오텍 연구실)
  • Published : 2003.09.01

Abstract

In an attempt to isolate myxobacteria from soil samples, we isolated swarm and fruiting body forming bacteria that have bacteriolytic activity on Coli-spot agar plate. For the classification of myxobacteria, 16S rDNA RFLP patterns were analyzed. Amplified 16S rDNAs of myxobacteria type strains (Family I, II, III and IV), negative control strains and soil-isolates were restricted with HaeIII, EcoRI and EcoRV, respectively. We found that the soil-isolates belongs to myxobacteria Family I, II, III.

토양 시료와 Coli-spot 한천평판 배지를 이용하여 myxobacteria를 분리하였다. 용균 현상이 관찰되는 Coli-spot 한천평판에서 myxobacteria의 swarm및 자실체 형성 여부를 확인하고, 확인된 자실체를 분리하여 VY/2 한천평판 배지에서 순수배양을 실시하였다. 분리 균주의 동정을 위하여 myxobacteria표준 균주 및 토양에서 분리한 균주들의 16S리보좀 DNA를 중합효소 연쇄 반응을 통해 증폭시킨 다음, 제한효소(HaeIII, EcoRI 및 EcoRV)로 절단하여 RFLP 양상을 비교하였다. 그 결과, 토양에서 분리한 균주들이 Family I, II, III의 myxobacteria에 속하는 것을 확인하였다.

Keywords

References

  1. Sci. Ann. Rep. Biologically active substances from micro-organisms: an interdisciplinary research project at the GBF Hofle,G.;H.Reichernbach
  2. Bergeys Manual of Systematic Bacteriology Order Myxococcales McCurdy,H.D.;J.T.Staley(ed.);M.P.Bryant(ed.);N.Pfenning(ed.);J.G.Holt(ed.)
  3. Biotechnol. Adv. v.11 Biologically active secondary metabolites from myxobacteria Reinchenbach,H.;G.Hofle https://doi.org/10.1016/0734-9750(93)90042-L
  4. The Prokaryotes The myxobacteria Reinchenbach,H.;M.Dworkin;A.Balows(ed.);H.G.Truper(ed.);M.Dworkin(ed.);W.Harder(ed.);K.H.Schleifer(ed.)