Isolation and Characterization of Bacteriolytic Wild Myxobacteria

용균성 야생 점액세균의 분리

  • 박수연 (호서대학교 자연과학부) ;
  • 이봉수 (호서대학교 자연과학부) ;
  • 김지훈 (호서대학교 자연과학부) ;
  • 이차율 (호서대학교 자연과학부) ;
  • 장은혜 (호서대학교 자연과학부) ;
  • 조경연 (호서대학교 자연과학부)
  • Published : 2004.09.01

Abstract

Myxobacteria are Gram-negative soil bacteria known to be a rich source of potentially useful secondary metabolites. We have isolated 204 strains of bacteriolytic myxobacteria from soil samples collected in Korea and determined their 16S rRNA sequences. Sequence analysis of the partially determined 16S rRNA sequences has suggested that 132 isolates (65% of total isolates) belong to the genus Myxococcus and 59 isolates (29% of total isolates) belong to the genus Corallococcus. Meanwhile, 4 isolates appear to be Archangium spp. and the other 4 isolates appear to be Stigmatella spp. Genera of the remained 5 isolates have not been identified because their 16S rRNA sequences are distantly related to those of known myxobacteria.

용균성 야생 점액세균 204균주를 국내 토양으로부터 순수분리하였고, 분리균주의 16S rRNA 부분 염기서열을 결정하였다. Ribosomal Database Project(RDP) II를 이용하여 분리균주 각각의 16S rRNA 염기서열을 분석한 결과 전체 분리균주의 65%를 차지하는 132 균주들이 Myxococcus 속에 속할 것으로 예상되었으며, 29%를 차지하는 59 균주들이 Corallococcus 속, 4 균주가 Archangium 속, 그리고 4 균주가 Stigmatella 속에 속할 것으로 분석되었다. 그리고 나머지 5 균주는 알려진 균주와의 유연관계가 멀어 분류가 확실하지 않았다. 한편, 16S rRNA염기서열의 비교분석은 분리균주의 50%가 16S rRNA부분 염기서열상에 적어도 한 염기 이상의 차이를 지니고 있음을 보여주었다. 하지만 동일한 염기서열을 지니는 것으로 분석된 균주에서도 서로 다른 집락모서리를 형성하는 등 다른 균주로 판명되는 것으로 보아 전체 분리균주는 다양성이 81% 이상인 다양한 균주들인 것으로 사료되었다.

Keywords

References

  1. J. Nat. Prod. v.62 KR025, A new cytotoxic compound from Myxococcus fulvus Ahn, J. W.;S. H. Woo;C. O. Lee;K. Y. Cho;B. S. Kim https://doi.org/10.1021/np9804233
  2. J. Mol. Biol. v.104 Transposition and fusion of the lac genes for selected promoters in E. coli using bacteriophage lambda and Mu Casadaban, M. https://doi.org/10.1016/0022-2836(76)90119-4
  3. Nucleic Acids Res. v.31 The Ribosomal Database Project (RDP-II): previewing a new autoaligner that allows regular updates and the new prokaryotic taxonomy Cole, J. R.;B. Chai;T. L. Marsh;R. J. Farris;Q. Wang;S. A. Kulam;S. Chandra;D. M. McGarrell;T. M. Schmidt;G. M. Garrity;J. M. Tiedje https://doi.org/10.1093/nar/gkg039
  4. Kor. J. Microbiol. Biotrchnol. v.30 Bacterial gliding motility Cho, K.
  5. FEMS Microbiol. Rev. v.24 Biology and global distribution of myxo-bacteria in soils Dawid, W. https://doi.org/10.1111/j.1574-6976.2000.tb00548.x
  6. Maxobacteria II Dworkin, M.;D. Kaiser.
  7. Maxobacteria II Protein secretion in myxobacteria Guespin-Michel, J. F.;B. Letouvet-Pawlak;F. Petit;Dworkin, M.(ed.);D. Kaiser(ed.)
  8. Kor. J. Microbiol. Biotechnol. v.31 Bioactive substances from myxobacteria Kim, Y. S.;W. C. Bae;S. J. Back
  9. J. Bacteriol. v.151 Fruiting body morphogenesis in submerged cultures of Myxococcus xanthus Kuner, M. J.;D. Kaiser
  10. Annu. Rev. Microbiol. v.55 Bacterial gliding motility: multiple mechanisms for cell movement over surfaces McBride, M. https://doi.org/10.1146/annurev.micro.55.1.49
  11. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology v.3 Order Myxococcales McCurdy, H. D.;Staley, J. T(ed.);M. P. Bryant(ed.);N. Pfennig(ed.);J. G. Holt(ed.)
  12. J. Bacteriol. v.171 Patterns of cellular interactions during fruiting body formation in Myxococcus xanthus O'Connor, K. A.;D. R. Zusman https://doi.org/10.1128/jb.171.11.6013-6024.1989
  13. Microbiology(5th ed.) Prescott, L. M;J. P. Harley;D. A. Klein.
  14. Myxobacteria II Biology of the myxobacteria: ecology and taxonomy Reichengbach, H.;Dworkin, M(ed.);D. Kaiser(ed.)
  15. Environ. Microbiol. v.1 The ecology of the myxobacteria Reichenbach, H. https://doi.org/10.1046/j.1462-2920.1999.00016.x
  16. J. Ind. Microbial. Biotechnol. v.27 Myxobacteria, producers of novel bioactive substances Reichengbach, H. https://doi.org/10.1038/sj.jim.7000025
  17. Drug Discovery from Nature Myxobacteria as producers of secondary metabolites Reichenbach, H.;G. Hofle.;Grabley S(ed.);R. Thiericke(ed.)
  18. The Procaryotes (2nd ed.) The myxobacteria Reichenbach, H.;M. Dworkin.;Balows A.(ed.);H. G. Truer(ed.);M. Dworkin(ed.);W. Harder(ed.);K. -H. Schleifer(ed.)
  19. Int. J. Syst. Bacteriol. v.3 The correlation between morphological and phylogenetic classification of myxobacteria Sproer, C.;H. Reichenbach;E. Stackebrandt