Food Science of Animal Resources (한국축산식품학회지)

Korean Society for Food Science of Animal Resources (한국축산식품학회)
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Characterization of a Korean Traditional Porcine Breed Using Microsatellite Markers and the Establishment of an Individual Identification System

Microsatellite Marker를 이용한 한국재래돼지 집단의 품종특성 및 원산지 추적을 위한 개체식별체계 설정

  • Kim, M.J. (National Livestock Research Institute) ;
  • Li, G.H. (Genomic Informatics Center Hankyong National University(G.R.R.C.)) ;
  • Oh, J.D. (Genomic Informatics Center Hankyong National University(G.R.R.C.)) ;
  • Cho, K.H. (National Livestock Research Institute) ;
  • Jeon, G.J. (National Livestock Research Institute) ;
  • Choi, B.H. (National Livestock Research Institute) ;
  • Lee, J.H. (Genomic Informatics Center Hankyong National University(G.R.R.C.)) ;
  • Hong, Y.S. (Genomic Informatics Center Hankyong National University(G.R.R.C.)) ;
  • Kong, H.S. (Genomic Informatics Center Hankyong National University(G.R.R.C.)) ;
  • Lee, H.K. (Genomic Informatics Center Hankyong National University(G.R.R.C.))
  • 김명직 (농촌진흥청 축산연구소) ;
  • 이관호 (한경대학교 유전정보연구소) ;
  • 오재돈 (한경대학교 유전정보연구소) ;
  • 조규호 (농촌진흥청 축산연구소) ;
  • 전기준 (농촌진흥청 축산연구소) ;
  • 최봉환 (농촌진흥청 축산연구소) ;
  • 이제현 (한경대학교 유전정보연구소) ;
  • 홍윤숙 (한경대학교 유전정보연구소) ;
  • 공홍식 (한경대학교 유전정보연구소) ;
  • 이학교 (한경대학교 유전정보연구소)
  • Published : 2007.06.30
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Abstract

This study was conducted to analyze the genetic characteristics of Korean Native Pigs(KNP), and to establish an individual identification system comprising many microsatellite markers located on different pig autosomes. Genotype data from 13 microsatellites typed in 446 animals was used to determine the validation of a method of individual identification in 4 KNP. A total of 112 alleles of the 13 microsatellites were detected and average heterozygosities(polymorphic information content) ranged from 0.286(0.423) to 0.686(0.796) in this study. Comparing the pattern of allele frequency among the KNP, Yorkshire, Landrace and Duroc breeds, there was specific differentiation between populations at multi-allelic loci. The cumulative power of discrimination(CPD) was 99.999% by including 10 microsatellite loci for the individual identification system. The probability that two different individuals incidentally have same genotype was estimated to be $0.36{\times}10^{-9}$. The system employing these 10 markers therefore proved to be applicable to the individual identification of KNP.

본 연구는 서로 다른 상염색체에 위치하고 있는 초위성체 유전 표지를 활용한 한국재래돼지 집단의 개체 식별시스템 설정을 위해 수행되었다. 공시재료는 4품종에서 총 446두가 사용되었으며 13종의 좌위에 대한 개체별 유전자형을 분석하였다. 이들 13종에서 출현된 이형접합도는 0.286-0.686였으며 marker 다형성 정보량은 0.399-0.796로 나타났다. 한국 재래돼지 집단에서 나타난 대립 유전자 발현 특성은 다른 대조 품종 집단과 매우 상이한 결과를 나타냈다. S0228좌위는 전체 8종의 대립유전자가 나타난 가운데 다른 3품종에서는 발현이 되지 않은 235 대립유전자가 한국 재래돼지 집단에서만 발현이 되었다. 5종의 초위성체 유전 표지를 활용할 경우 누적 개체 식별력은 99.999%를 나타냈으며 두 마리의 서로 다른 개체가 서로 같은 유전자형을 가질 짝확률은 $0.36{\times}10^{-9}$으로 추정되었다. 따라서 10종의 선정된 유전 표지는 한국재래돼지 집단에서 적정 신뢰도를 제공할 수 있는 개체 식별 시스템을 설정할 수 있을 것으로 생각된다.

Keywords

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